Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs12P50716 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms