Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms