Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms