Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms