Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxc13P50207 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms