Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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