Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prox1P48437 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prox1P48437 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms