Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epb41P48193 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Epb41P48193 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms