Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13P47963 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms