Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms