Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms