Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms