Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddit3P35639 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms