Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab20P35295 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab20P35295 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms