Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms