Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Notch4P31695 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Notch4P31695 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms