Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc11P31313 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms