Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Msr1P30204 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms