Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VtnP29788 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VtnP29788 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VtnP29788 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
VtnP29788 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
VtnP29788 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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