Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd8P29595 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd8P29595 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd8P29595 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd8P29595 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd8P29595 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd8P29595 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms