Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcdP28867 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcdP28867 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms