Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BgnP28653 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BgnP28653 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BgnP28653 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BgnP28653 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BgnP28653 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BgnP28653 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BgnP28653 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BgnP28653 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BgnP28653 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BgnP28653 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms