Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms