Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms