Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U2af2P26369 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms