Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd12P23812 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms