Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
HmbsP22907 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms