Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RarbP22605 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RarbP22605 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RarbP22605 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RarbP22605 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RarbP22605 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RarbP22605 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RarbP22605 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RarbP22605 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RarbP22605 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RarbP22605 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RarbP22605 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RarbP22605 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RarbP22605 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RarbP22605 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RarbP22605 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms