Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tap1P21958 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tap1P21958 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms