Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmnb2P21619 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms