Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcb1aP21447 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms