Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms