Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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