Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VimP20152 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VimP20152 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VimP20152 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VimP20152 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VimP20152 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms