Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox5bP19536 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox5bP19536 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox5bP19536 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox5bP19536 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox5bP19536 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cox5bP19536 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox5bP19536 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox5bP19536 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cox5bP19536 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cox5bP19536 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox5bP19536 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox5bP19536 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox5bP19536 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms