Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54P14576 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms