Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb1P13372 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms