Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd4P10628 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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