Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a2P08122 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms