Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnfP06804 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TnfP06804 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnfP06804 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnfP06804 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnfP06804 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnfP06804 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnfP06804 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TnfP06804 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TnfP06804 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TnfP06804 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TnfP06804 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TnfP06804 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms