Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9P06683 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9P06683 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9P06683 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9P06683 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9P06683 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9P06683 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms