Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06336 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06336 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06336 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06336 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06336 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06336 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06336 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06336 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06336 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms