Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lamc1P02468 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamc1P02468 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms