Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Ab1P01921 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-Ab1P01921 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms