Protein–RNA interactions for Protein: P01677

Ig kappa chain V-VI region TEPC 601/TEPC 191, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01677 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01677 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01677 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01677 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01677 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01677 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01677 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01677 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms