Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01656 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01656 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01656 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01656 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01656 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01656 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01656 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01656 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01656 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01656 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01656 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01656 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms