Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01649 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01649 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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P01649 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01649 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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