Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01648 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01648 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01648 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01648 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01648 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01648 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01648 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01648 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01648 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms