Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifnb1P01575 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms