Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ShdO88834 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ShdO88834 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ShdO88834 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShdO88834 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShdO88834 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShdO88834 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ShdO88834 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms